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No space left on device:磁盘明明没满为什么还报错?

除了磁盘容量,inode、用户配额和临时目录也可能先耗尽。测序流程的中间文件通常远大于最终结果。

No space left on device

这个报错是什么意思?

目标分区、临时目录、inode 或用户配额已经没有可用空间。

先做这三个检查

  1. 同时检查容量和 inode,而不是只看 df -h。
  2. 定位缓存、临时 BAM、排序文件等大目录。
  3. 把 TMPDIR 和中间结果迁移到容量充足的数据盘。

可直接执行的检查命令

df -h
df -i
du -sh ./* | sort -h
echo $TMPDIR

日志更长,还是定位不准?

把完整报错前后关键行贴进诊断工具,自动区分环境问题、软件问题和真实硬件瓶颈。

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留下手机号,我们会围绕“No space left on device”核对环境与资源条件;需要迁移时,可一并评估 128G 生信服务器 3 天试用。

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