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Seurat duplicate cell names:合并对象细胞名重复

多个 10x 样本常共享相同 barcode,直接 merge 会自动改名或造成追踪困难。

Some cell names are duplicated across objects provided Seurat

这个报错是什么意思?

各样本细胞条形码没有样本前缀,合并后无法保持全局唯一。

先做这三个检查

  1. 合并前为每个样本添加稳定前缀。
  2. 保留原 barcode 和样本字段用于回溯。
  3. 合并后验证 Cells 全局唯一且 metadata 行名同步。

可直接执行的检查命令

anyDuplicated(Cells(object))
object <- RenameCells(object, add.cell.id = 'sampleA')
merge(x, y, add.cell.ids = c('A','B'))

日志更长,还是定位不准?

把完整报错前后关键行贴进诊断工具,自动区分环境问题、软件问题和真实硬件瓶颈。

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留下手机号,我们会围绕“Some cell names are duplicated across objects provided Seurat”核对环境与资源条件;需要迁移时,可一并评估 128G 生信服务器 3 天试用。

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