居然还能从这个角度进行MR分析?选题选的好,文章跑不了!浙大一附院一区新作来袭!

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  1. 研究团队采用了多组学孟德尔随机化分析方法,通过利用遗传变异作为工具变量,评估了饮酒对精神障碍的影响,以及DNA甲基化和基因表达在其中的作用。为了验证结果的可靠性,研究团队进行了多种敏感性和验证分析,包括共定位分析。

2. 研究团队从全基因组关联研究(GWAS)、尼古丁使用测序联盟(GSCAN)、DNA甲基化遗传学联盟(GoDMC)以及精神病基因组学联盟(PGC)获取数据,包括941280条一般酒精摄入量数据,51710 ~ 500199条精神疾病数据以及9643个酒精相关DNA甲基化CpG位点等数据。

3. 研究发现,病理性饮酒行为与精神疾病风险增加相关,去除异常值或控制酒精摄入后这种关联依然存在。MR分析确认了10个与酒精相关的CpG位点,它们与精神疾病存在因果关系。此外,在大脑皮层的引导下,这些CpG位点相关的基因(包括RERE、PTK6、GATAD2B、COG8、PDF和GAS5)的表达与精神疾病显著相关

4. 本研究的创新之处在于采用了多组学孟德尔随机化方法,从遗传角度探究了饮酒、DNA甲基化和精神障碍之间的因果关系。通过这种方法,研究团队能够更准确地评估这些因素之间的关联,为未来研究和临床实践提供了新的思路。小伙伴们觉得这个研究角度和思路怎么样呀?是不是有种一语惊醒梦中人的感觉?你也想要这种创新角度和思路吗?那就赶紧来找小云交流学习吧!

题目:饮酒、DNA甲基化和精神疾病:一项多组学孟德尔随机化研究,以调查因果关系

杂志:Addiction

影响因子:IF = 6.0

发表时间:2024年03月

研究背景

过去的研究已经发现饮酒和精神障碍之间存在联系,但具体的因果关系和分子机制尚未完全明确。因此,这项研究旨在通过MR方法来评估饮酒对精神障碍的影响,以及DNA甲基化和基因表达在其中的作用。通过深入研究这些复杂关系,研究团队希望为理解和处理与饮酒、DNA甲基化和精神障碍相关的问题提供新的见解和解决方案。

数据来源

研究人员从全基因组关联研究(GWAS)、尼古丁使用测序联盟(GSCAN)、DNA甲基化遗传学联盟(GoDMC)以及精神病基因组学联盟(PGC)获取研究数据,包括以下部分:

  1. 一般酒精摄入量的汇总数据:941 280条
  2. 精神疾病相关数据:51710 ~ 500199条,包括精神分裂症、重性抑郁症和双相情感障碍
  3. 酒精相关DNA甲基化CpG位点:9643条
  4. 病理性饮酒行为:313 959条酒精使用障碍数据,435563条问题性酒精使用数据
  5. mQTL数据:27 750条血液数据,1160条脑部数据

研究思路

本研究使用了从全基因组关联研究(GWAS)、尼古丁使用测序联盟(GSCAN)、DNA甲基化遗传学联盟(GoDMC)以及精神病基因组学联盟(PGC)获取的数据。首先,研究团队利用MR确定了饮酒对精神障碍的潜在影响。其次,通过整合大脑和血液表达量QTL数据,结合甲基化MR和共定位分析,识别了在酒精介导的精神障碍病因中起因果作用的CpG位点及其对应的基因。最后通过整合数据分析,确定了精神障碍的致病基因。研究团队通过这些分析,揭示了饮酒对精神障碍的潜在因果关系,以及与之相关的DNA甲基化和基因表达的生物学机制,为高风险个体的干预提供了新的见解。

研究主要流程图

主要结果

  1. 饮酒遗传倾向对精神疾病预后的因果影响

MR分析结果显示,对于精神分裂症而言,去除异常值后发现每周饮酒对其有显著的因果影响,并且基因预测的酒精使用障碍和问题性酒精使用与精神分裂症风险增加相关;对于重性抑郁症而言,每周饮酒也显示出对其有显著影响;对于双相情感障碍而言,没有发现显著因果关系的证据。

酒精对精神疾病预后的影响MR分析图

  1. 酒精相关DNA甲基化对精神疾病预后的因果影响

研究人员使用DNA甲基化MR分析对275个与酒精相关的CpG位点进行了研究,发现其中13个、8个和10个CpG位点与精神分裂症、重性抑郁症和双相情感障碍的风险相关。进一步分析显示部分CpG位点影响两种或三种精神疾病,并通过共定位分析确定了与这些疾病相关的CpG位点。敏感性分析和验证分析进一步支持了这些结果。此外,研究发现某些CpG位点的甲基化与相应基因表达相关,而这些基因的表达与精神疾病的风险相关,尤其是在特定脑区域。

MR和共定位结果表明酒精相关DNA甲基化与精神疾病风险之间存在关联

MR结果表明已识别基因的表达与精神疾病风险之间存在关联

文章小结

本研究通过MR分析探究了饮酒、DNA甲基化和精神障碍之间的关系。研究结果显示,饮酒对精神障碍的风险具有因果关系,特定的酒精相关CpG位点与精神障碍存在关联,相关基因在这些关系中发挥作用。这些发现为理解饮酒与精神障碍之间的生物学机制提供了新的见解,有助于制定针对高风险个体的干预措施。又解读完一篇文章啦,虽然这篇文章的分不是特别高,但也是一篇优秀的孟德尔随机化模版文章哦,大家一定要认真总结归纳学习哦,对大家后期写文章大有裨益~如果你没有那么多时间总结归纳又想快速发文,小云这里有大量现成的模版和方法哦,欢迎大家来找小云咨询呀!