分享一个数据库:KnockTF2.0,这个数据库的思路类似于CMAP,事先做实验敲除转录因子然后获得基因表达谱的变化,可以知道哪些基因是受这个转录因子调控的,但是有些基因可能是因为上游基因的变化而变化的不是直接由转录因子调控的。建议弄一个单细胞marker数据库,收集单细胞手动注释的文献和marker。
分享一个数据库:KnockTF2.0,这个数据库的思路类似于CMAP,事先做实验敲除转录因子然后获得基因表达谱的变化,可以知道哪些基因是受这个转录因子调控的,但是有些基因可能是因为上游基因的变化而变化的不是直接由转录因子调控的。建议弄一个单细胞marker数据库,收集单细胞手动注释的文献和marker。