数据整理、注释和解释佼佼者 — annotate R包

在数据整理、注释和解释方面,R语言包annotate无疑是一个佼佼者的存在 R语言包annotate是一个广泛 […]

小果的Circos课堂

1 Circos简介 相信大家和小果一样在查阅文献时往往惊叹于文中图片的绚烂多彩和简明扼要,正所谓“一图胜千言 […]

seqkit ——序列梳理神器

小果在最近发现了一个处理序列时候发现了一个好用的生信小工具。今天小果把它分享给你们~ 简介 Seqkit 是一 […]

教你使用R语言包genefilter预处理数据和筛选数据的保姆级教程

在生物学研究中,我们经常需要处理大规模的基因表达数据,这些数据可能来自不同条件下的实验或疾病样本。genefi […]

单细胞测序分析(六)Seurat寻找marker基因以及细胞鉴定

上一期小果使用了三种降维算法对单细胞数据进行了降维和聚类,将2700个细胞分成了9个细胞亚群。并比较了三种算法 […]

纯代码实操,小果带你计算基因与免疫细胞在TMB中的相关性

我们大家知道基因与多种免疫细胞类型之间有着相关性,那么了解指定基因与免疫细胞类型之间的相互作用,以及是否存在相 […]

单细胞测序分析(五)R包Seurat三种算法对数据聚类降维

大家好,小果今天继续介绍R包Seurat单细胞测序分析。 上一期我们用Seurat对数据进行了进一步的过滤,过 […]

学会CMplot,绘制出比qqman更优秀的GWAS可视化结果

在最近的这段时间里相信做科研的各位小伙伴都被GWAS和孟德尔随机化刷过屏,小果也有在做教学的推文哦~有兴趣的小 […]

testing-based procedures减少变量简化模型预测结果的好帮手

在统计假设检验中,testing-based procedures是一类常用的方法,用于在生物信息数据学中进行 […]

保姆级教程!!小果教你学习曼哈顿图!Manhattan图!!

有的小伙伴可能听说过曼哈顿图,但是并不了解,也不知道是来做什么的,其实,曼哈顿因为其形似曼哈顿摩天大楼,所以被 […]