分类: 云生信学生物信息学
数据整理、注释和解释佼佼者 — annotate R包
在数据整理、注释和解释方面,R语言包annotate无疑是一个佼佼者的存在 R语言包annotate是一个广泛 […]
教你使用R语言包genefilter预处理数据和筛选数据的保姆级教程
在生物学研究中,我们经常需要处理大规模的基因表达数据,这些数据可能来自不同条件下的实验或疾病样本。genefi […]
单细胞测序分析(六)Seurat寻找marker基因以及细胞鉴定
上一期小果使用了三种降维算法对单细胞数据进行了降维和聚类,将2700个细胞分成了9个细胞亚群。并比较了三种算法 […]
纯代码实操,小果带你计算基因与免疫细胞在TMB中的相关性
我们大家知道基因与多种免疫细胞类型之间有着相关性,那么了解指定基因与免疫细胞类型之间的相互作用,以及是否存在相 […]
单细胞测序分析(五)R包Seurat三种算法对数据聚类降维
大家好,小果今天继续介绍R包Seurat单细胞测序分析。 上一期我们用Seurat对数据进行了进一步的过滤,过 […]
学会CMplot,绘制出比qqman更优秀的GWAS可视化结果
在最近的这段时间里相信做科研的各位小伙伴都被GWAS和孟德尔随机化刷过屏,小果也有在做教学的推文哦~有兴趣的小 […]
testing-based procedures减少变量简化模型预测结果的好帮手
在统计假设检验中,testing-based procedures是一类常用的方法,用于在生物信息数据学中进行 […]
保姆级教程!!小果教你学习曼哈顿图!Manhattan图!!
有的小伙伴可能听说过曼哈顿图,但是并不了解,也不知道是来做什么的,其实,曼哈顿因为其形似曼哈顿摩天大楼,所以被 […]