主成分分析PCA,你不懂的都在这了

许多生信分析报告里都会有上一张PCA图,那它是什么,又为什么会如此重要呢?小果今天就为大家讲解。 主成分分析( […]

差异分析魔法师:DESeq2与基因的魔幻冒险!

hello,今天小果教大家如何使用DESeq2包对counts表达矩阵进行差异基因分析,并对分析结果绘制火山图 […]

比blast还优秀的序列比对工具?HMMER来了

在日常的生信分析中,我们常见的序列比对工具基本都是blast进行比对。但是从研究基因功能的角度来讲,HMMER […]

ggplot2 之作:多彩和谐的通路富集可视化之旅 !

hello,今天小果来教大家如何对KEGG富集分析的结果通过ggplot2实现可视化并绘制对应的KEGG通路网 […]

五分钟带你快速上手基因功能注释

在进行基因的差异分析之后,我们需要对基因的功能进行注释。基因功能注释的目的是通过分析基因的序列和结构以及已知的 […]

差异表达样本少无重复?快使用edgeR,小果三分钟教你上手

实验数据获得并不容易,而且成本高昂,有时只是想大致看一下几种条件的差异表达,在正式的实验前做一个预实验很有必要 […]

非模式生物基因注释信息不会找?不怕,小果教你用AnnotationHub包轻松拿捏

非模式生物的注释信息检索 自RNA测序(RNA-seq)的技术被发明以来,它在分子生物学的领域内得到了广泛的应 […]

干货批量处理泛癌相关生存KM分析绘图

生存分析中的Kaplan-Meier曲线(也称为KM曲线)是一种常用的统计方法,用于估计不同组别之间的生存函数 […]

小果带你批量处理泛癌生存分析

生存分析是一种统计方法,用于分析个体在给定时间段内发生某个事件(如死亡)的概率或时间。生存分析可用于评估不同因 […]

小果三分钟教会你如何对Trinity转录本进行下游分析(下)

在上一期的教学中小果讲到了如何下载和使用Trinity组装转录本,并且评估转录本的质量,在本期中我们将当组装完 […]