结直肠癌新的缺氧和乳酸代谢相关分子分型和预后特征

PMID: 38902737

该研究从TCGA和GEO数据库下载CRC的Bulk和单细胞RNA测序和临床数据。HRGs和LMRGs来源于分子特征数据库。采用R软件包DESeq2进行差异表达分析。使用无监督聚类进行分子分型。采用单因素Cox回归、随机森林模型、LASSO和多因素Cox回归分析得出预测特征。最后，通过体外实验验证缺氧前后肿瘤细胞对化疗药物的敏感性。通过对缺失数据和乳酸代谢的研究，构建了两个基因集并分析其交集，创建了三个亚型进行预后分析，发现某些亚型的预后效果较差。