gzip unexpected end of file：压缩文件被截断
gzip 在到达合法结束标记前文件就结束，说明内容不完整。
gzip unexpected end of file这个报错是什么意思？
下载/传输中断、上游写入被杀或磁盘空间耗尽。
先做这三个检查
- 用 gzip -t 确认完整性。
- 与来源比较文件大小和校验值。
- 优先重新下载或生成，不要在截断 FASTQ 上继续分析。
可直接执行的检查命令
gzip -t sample.fastq.gz
ls -lh sample.fastq.gz
md5sum sample.fastq.gz日志更长，还是定位不准？
把完整报错前后关键行贴进诊断工具，自动区分环境问题、软件问题和真实硬件瓶颈。
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留下手机号，我们会围绕“gzip unexpected end of file”核对环境与资源条件；需要迁移时，可一并评估 128G 生信服务器 3 天试用。
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