Nextflow Missing output file(s) expected by process
进程退出码为 0，但实际生成文件名与 output path 声明不匹配。
Missing output file expected by process Nextflow这个报错是什么意思？
脚本输出路径、通配符或可选输出声明错误。
先做这三个检查
- 进入报错 work 目录查看真实产物。
- 让 process output 声明与命令生成文件完全一致。
- 确实可选的产物使用 optional，而不是用宽泛通配符掩盖错误。
可直接执行的检查命令
nextflow log -f name,status,exit,workdir
cd work/xx/xxxx
ls -la; cat .command.sh日志更长，还是定位不准？
把完整报错前后关键行贴进诊断工具，自动区分环境问题、软件问题和真实硬件瓶颈。
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先判断是否真缺算力不自动开通付费服务本站不保存日志原文