Nextflow process terminated with an error exit status
Nextflow 只是报告子进程非零退出，真正原因在 .command.err/.command.log。
Process terminated with an error exit status Nextflow这个报错是什么意思？
底层软件参数、资源、输入或容器环境失败。
先做这三个检查
- 定位具体 work 目录和退出码。
- 在该目录原样执行 .command.run 复现。
- 根据底层错误修参数或资源，不要只提高 Nextflow 重试次数。
可直接执行的检查命令
nextflow log -f name,status,exit,workdir
cd WORKDIR
cat .command.err
cat .command.sh日志更长，还是定位不准？
把完整报错前后关键行贴进诊断工具，自动区分环境问题、软件问题和真实硬件瓶颈。
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