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STAR genome version is incompatible with genome index

STAR 可执行版本与现有 GenomeDir 索引格式不兼容。

STAR genome index is incompatible with this version

这个报错是什么意思?

索引由不同大版本 STAR 生成,或索引目录不完整。

先做这三个检查

  1. 记录生成索引和运行比对的 STAR 版本。
  2. 使用当前 STAR 重新构建索引。
  3. 确认 FASTA、GTF 和 sjdbOverhang 与项目一致后替换。

可直接执行的检查命令

STAR --version
cat GenomeDir/genomeParameters.txt | head
STAR --runMode genomeGenerate --genomeDir NewGenomeDir --genomeFastaFiles reference.fa --sjdbGTFfile genes.gtf

日志更长,还是定位不准?

把完整报错前后关键行贴进诊断工具,自动区分环境问题、软件问题和真实硬件瓶颈。

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留下手机号,我们会围绕“STAR genome index is incompatible with this version”核对环境与资源条件;需要迁移时,可一并评估 128G 生信服务器 3 天试用。

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