原始数据有多少？
全部样本加起来，选最近的
分析需求与团队
两个小问题
使用方式与周期
两个小问题
偏好与存储
两个小问题
现状与时间
最后两个问题
从 FASTQ 到 MAGs
七步完成宏基因组全流程，各步骤算力需求差异显著
质控与去宿主
去除低质量 reads 和宿主污染，I/O 密集型
序列组装
全流程最吃内存的步骤，50 样本共组装峰值 300—500GB
基因预测与非冗余基因集
构建 NR 基因集，内存随样本数线性增长
物种注释
Kraken2 数据库 60GB，DIAMOND 比 NR 耗时最长
功能注释
四套数据库合计 200GB+，多库并行比对
分箱与 MAGs
恢复单菌基因组，计算密集型
统计与可视化
差异分析、LEfSe、PCoA，中量计算
为什么选我们
针对宏基因组分析的实际算力痛点
共组装内存瓶颈
50 个肠道样本 MEGAHIT 共组装，峰值内存 300—500GB。常规工作站 64GB 内存无法完成，任务中断后需从头开始。我们的配置提供 512GB+ 内存，确保组装一次完成。
数据库预装
NR 300GB、eggNOG 60GB、KEGG 20GB、CAZy 5GB、CARD 3GB，合计约 400GB。全部预装配置完毕，无需自行下载和构建索引。
DIAMOND 比对加速
DIAMOND 比对 NR 库，8 核需 24 小时/百万条基因。96 核并行降至 3 小时，大幅缩短注释周期。
多人协作调度
SLURM 作业调度系统支持多人并发提交，独立账号、独立环境、独立目录，权限隔离互不影响。
NVMe 全闪存架构
读取速度 3000MB/s，大文件比对不受 I/O 限制。支持 2TB 至 64TB 在线扩容，不影响运行中的任务。
200 个环境样本共组装，之前在学校集群排队两周。使用独享服务器后，512GB 内存一次载入，三天完成全部 contigs 组装。
— 四川大学华西医院 · 微生物组研究团队
工作站 / 公有云 / 云生信
三种方案的实际差异对比
| 对比项 | 工作站 / 笔记本 | 公有云按小时 | 云生信 |
|---|---|---|---|
| 共组装内存上限 | 64—128GB，易 OOM | 可临时升级，费用较高 | 512GB—1TB，稳定完成 |
| 数据库预装 | 需自行配置 2—3 天 | 需自行配置 | NR + eggNOG + KEGG 全部就绪 |
| DIAMOND 比 NR（百万条） | 24 小时以上 | 取决于实例规格 | 3 小时（96 核并行） |
| 多人并发 | 资源争抢 | 按实例计费 | SLURM 调度，互不干扰 |
| 费用模式 | 一次性投入，配置固定 | 按月约 5000+ 元 | 独享物理机，长期稳定 |
| 运维 | 自行负责 | 自行负责 | 专人运维，全程技术支持 |
你可能想问的
组装步骤（MEGAHIT / metaSPAdes）的内存需求是转录组分析的 5—10 倍。50 个样本共组装峰值内存可达 300—500GB。功能注释阶段 DIAMOND 比对 NR 库的计算量也显著高于转录组定量分析。
共组装将所有样本 Clean Reads 合并后统一组装，能恢复低丰度物种基因组，但内存需求随样本数线性增长。单样本组装内存固定，但会丢失低丰度信号。多数研究采用共组装方案。
无需自行安装。平台预装 Kraken2、DIAMOND NR、eggNOG、KEGG、CAZy、CARD、dbCAN 等全部常用数据库，合计约 400GB，索引已构建完毕。数据库定期更新。
支持 MEGAHIT、metaSPAdes、Kraken2、DIAMOND、eggNOG-mapper、MetaBAT2、MaxBin2、CheckM、STAMP、QIIME2 等主流宏基因组分析工具。支持 Snakemake / Nextflow 构建自定义流程，可通过 conda 创建独立环境。
费用根据配置不同，月付几百至几千元不等，年付性价比更高。支持对公转账、开具发票。完成测算后技术顾问将提供详细报价单，含配置方案、价格及付款方式。
专人运维，7×24 小时监控。硬件故障和网络问题由我们负责解决。软件环境和数据库问题可联系技术顾问协助。分析流程层面的问题，生信工程师可提供远程支持。
如使用本平台算力资源，建议在文章致谢部分注明。我们可提供致谢模板和技术支持说明文档。
年付付费不限使用时长，较公有云按小时计费降低 60% 以上。预装生信环境和数据库，独享物理机不受其他用户影响，专人运维保障稳定性。
