全外显子组测序 · 算力配置工具

靶向捕获编码区
高深度变异检测
队列规模自适应配置

外显子组约占基因组 1.5%(约 30 Mb),通过探针捕获富集后进行高深度测序(≥100×),聚焦蛋白质编码区变异。根据样本规模、并发任务数与存储周期,推算匹配的 CPU、内存与存储配置。

GRCh38 参考基因组 · ≥100× 覆盖深度 · On-target >99% · 探针 bed 预置
Exome Capture
GRCh38 · 30 Mb 目标区域
WES
3.2 Gbp 全基因组 1.5% 编码区
0x 100x
30 Mb
捕获区域
100x
平均深度
>99%
On-target

算力配置测算

回答四个问题,获取匹配的算力配置

WES 样本数量?

S
10 例以内
小规模验证
常见
M
10—50 例
常见规模
L
50 例以上
大队列研究

团队规模?

1
1 人
单人使用
2
2—3 人
小型团队
4
4—10 人
中型团队
+
10 人以上
大型团队

同时使用人数?

1
1 人并行
串行分析
常见
2
2—3 人并行
常见并发
4
4+ 人并行
高并发
?
不确定
待评估

偏好与周期?

$
价格优先
控制成本
推荐
B
均衡型
性价比推荐
F
速度优先
最快完成

使用周期?

1
1 个月
短期试用
3
3 个月
季度项目
最多
6
6 个月
半年周期
Y
1 年
长期稳定

数据存储周期?

T
临时存储
短期分析
H
半年存储
中期保存
常见
Y
1 年存储
常见周期
L
长期存储
归档保存

当前计算环境?

N
无服务器
准备新购
W
电脑跑不动
性能不足
O
服务器太慢
需要升级

期望上线时间?

1
1 个月内
急需上线
Q
1 个季度内
规划中
L
暂不着急
了解方案
?
不确定
待定

WES 全流程分析管线

从原始 FASTQ 到变异注释与队列分析,六步完成

01
低需求

质控与接头去除

fastp Trimmomatic
02
高需求 · 瓶颈

BWA-MEM2 比对

BWA-MEM2 minimap2
32 核需 2 小时/样本
03
中需求

去重与 BQSR

Picard GATK BQSR
04
高需求 · 瓶颈

变异检测

GATK HC Mutect2 Strelka2
16 核需 4—8 小时/样本
05
中需求

变异注释

VEP ANNOVAR SnpEff ClinVar
06
高需求

队列 Burden 分析

GenotypeGVCFs PLINK SAIGE
百人队列需 128GB+ 内存

为什么选择云生信

预装环境、独享物理机、专人运维,开箱即用

预装全流程环境

BWA-MEM2 索引、GATK 资源包、VEP 注释数据库、Capture probe bed 全部预装

80GB+
预装数据
立刻
环境搭建

独享物理机

64 核 CPU 全程满载,不受虚拟化损耗,性能零折损

64 核
最大 CPU
512GB
最大内存

专人运维保障

7x24 小时监控,硬件网络问题平台负责,专注科研本身

7x24
监控
60%+
降本

不只是算力,更是你的生信工作台

真正花时间的往往不是分析数据,而是折腾环境

Conda 环境一键部署

复现文献先花半天配 Conda?云生信常用分析软件及依赖提前配置,Conda 环境一键恢复,环境损坏、项目迁移也能快速复原。

告别配环境

AI 辅助编程

支持按需部署 Claude Code、Codex CLI、Gemini CLI。AI 帮你写代码、排查报错、优化流程,把 API 和依赖安装的前期折腾交给平台。

AI 写代码

WebSSH 浏览器直连

无需安装 SSH 客户端,打开浏览器即可登录服务器。在线文件管理,直接浏览、上传、下载和编辑文件,服务器就是在线生信工作台。

浏览器即终端

GEO 数据一键下载

公共数据库下载数据、整理目录、配置环境不再重复操作。GEO 数据集一键检索与下载,同步完成 Conda 环境部署,一步到位。

数据环境一起准备

数据双重保障

RAID5 实时容错,单块硬盘故障不影响数据正常使用。每周冷备份再增加一道保障,未发表课题和重要项目数据安心存储。

RAID5 + 冷备份

1V1 生信技术支持

不只是运维。1V1 技术支持覆盖服务器使用、软件安装、环境配置、代码报错、分析流程运行,新手不必再花大量时间搜索教程。

生信老师协助
"200 例遗传病 trio 家系 WES,之前在工作站上跑了一个多月。使用独享服务器后,64 核并行比对加 GATK 变异检测,一周完成全部样本的胚系变异检测和注释。"
— 上海交通大学医学院附属新华医院 · 儿童遗传病研究团队
4x
比对加速
BWA-MEM2 并行比对
100x
推荐深度
外显子组覆盖
30Mb
捕获区域
编码区目标 bed

开始你的 WES 全流程分析

回答四个问题,获取专属算力配置与报价

开始测算

常见问题

关于全外显子组测序算力配置的常见疑问

外显子组仅占基因组 1.5%,数据量约为 WGS 的 1/10,但变异检测和注释流程相同。WES 对 I/O 要求较低,但 100x 深度下比对和变异检测仍需充足 CPU。

可以。平台支持自定义 bed 文件,覆盖区域分析、On-target 统计、深度分布均按自定义区域计算。

推荐配对检测(Tumor-Normal),可过滤胚系变异假阳性。也支持仅 Tumor 模式,但需提供 panel of normals。

50 例以下队列 64GB 足够;100 例以上联合基因分型需 128GB+;500 例以上大规模关联分析建议 256GB+。

支持上传、邮寄硬盘、服务器间直传。大样本推荐邮寄硬盘到机房直接挂载,传输速度最快。