
一、Symphony包简要说明
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将Reference数据集嵌入UMAP空间中,再将Query数据集(待注释数据集)嵌入到与Reference数据集相同的UMAP空间。 -
使用KNN算法,根据Reference数据集,计算距离Query细胞最近的K个Reference细胞邻居,从而确定最可能的cell type。
二、代码实操







本期小云和小伙伴们分享了单细胞数据分析的一个典型流程,包括数据预处理、缩放、降维和聚类分析。这些步骤有助于理解数据的结构,识别不同的细胞亚群,并探索它们之间的差异。并且在这个过程中,我们也能够感受到Symphony包是一个功能非常全面全面、操作较为简便的单细胞数据分析工具,他为我们提供了强大的支持。希望本期的内容对小伙伴们有帮助,期待我们下期再见!最后如果各位觉得自己运行代码太麻烦,欢迎用我们的云生信小工具,只要输入合适的数据就可以直接出想要的图呢,附云生信链接
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原文始发于微信公众号(云生信学生物信息学):还在为单细胞数据分析而苦恼? Symphony R包来解救你!【代码分享100】