云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-11-19 单细胞之找寻受影响最大的细胞类型,Augur来帮忙啦~ 各位做单细胞的小伙伴们有没有这样的烦恼呀?最近小果总是发现每次都找不到想要往下分析的点,… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-10-30 单细胞类型鉴定和解释的准确性欠佳?CASCC自适应吸引子算法给你提供额外视角! 前言 小果见面会又要开始了,虽然小果实验很忙,但是看到好用的单细胞聚类R包还是忍不住第一时… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-10-28 空间转录组学数据处理只依赖R语言?让我们从scanpy开始,拥抱python吧! 前言 空间转录组学分析,是近几年的一个热点。相信小伙伴们对于seurat再熟悉不过了!但是seurat… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-10-28 单细胞RNA测序模拟,Splatter包让你的研究飞起来! 嘿,科研小伙伴们,小师妹我又来啦!今天,我要给大家带来一个超级实用的生物信息学工具——Splat… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-10-17 懒人福利!纯干货!Pianno为空间转录组内的空间点自动定义结构或细胞类型 前言 小伙伴们,还记不记得单细胞自动注释工具SingleR?是不是用起来爽爆了!让原本很难得细胞… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-10-11 你还在为单细胞RNA测序数据发愁吗?试试SCONE包,让你轻松轻松校正数据偏差,探索生物学新世界! 大家好!今天我想和大家分享一个专门用于单细胞RNA测序数据标准化和质量控制的R包——SCONE包。通… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-10-11 没听错吧!单细胞中也可以进行免疫浸润分析?SpatialCells带给你新的体验! 前言 谈起生信分析必备项目免疫浸润分析,小伙伴们再熟悉不过了!像小伙伴们耳熟能详的ImmuCell… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-10-11 空间转录组中的细胞通讯分析你get到了吗?大海哥帮你轻松搞定! 前言 沉浸在暑期快乐时光里的小伙伴们快收收心吧!千万别忘记大海哥的每日小课堂啊!厌倦了游戏… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-10-11 多种单细胞富集评分算法打包到R包irGSEA!批量评分方法减少引入偏差! 前言 小伙伴们都趋向于使用未校正批次效应后的数据进行差异基因分析,但是在富集分析的过程中,… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-10-11 拒绝千篇一律!R包Ragas带你打开单细胞聚类分析及可视化的新大门 前言 今天小果又和大家见面了,跟随小果的步伐来给自己空瘪的皮囊注入点知识的能量吧!接触单细… 阅读全文 ›