单细胞分析

云生信学生物信息学 · 2026-10-24

Cell Ranger count 为什么总卡在半路？先把内存和工作盘配对

Cell Ranger count 跑不完，不一定是命令问题。本文从 FASTQ、参考转录组、峰值内存、工作盘和…

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单细胞分析 · 2026-10-20

STARsolo 单细胞转录组为什么 16 GB 能建索引，映射时却不稳？服务器资源规划

STARsolo 的稀疏索引可以适配 16 GB 内存，但人类索引共享内存量级约 31 GB、典型哺乳动物索引…

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云生信学生物信息学 · 2026-10-19

双虚拟、三虚拟跑不动？租服务器前，先分清这三种瓶颈

虚拟敲除爆内存，批量对接排队，GPU 加上后还是慢？按网络分析、批量筛选和 GPU 任务拆解瓶颈，…

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单细胞分析 · 2026-10-17

单细胞 Multiome 为什么 64 GB 能启动、却跑不稳？Cell Ranger ARC 2.2 资源规划

Cell Ranger ARC 2.2 最低需要 8 核、64 GB 内存和 1 TB 可用磁盘。结合官方 PBMC 10k 测试，讲…

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云生信学生物信息学 · 2026-10-16

虚拟敲除、过表达、筛选都做了，为什么机制仍然讲不通？

虚拟敲除、过表达和筛选都做了，机制为什么仍然讲不通？从模型适用范围、证据独立性和作用方向…

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云生信学生物信息学 · 2026-10-14

双虚拟怎么做才有价值？先把“候选基因”接到可验证的问题上

虚拟敲除和虚拟筛选分别回答什么问题？从目标细胞、候选基因到干预方向，本文用判断表说明两类…

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云生信学生物信息学 · 2026-10-13

基因升高了，到底是谁在使劲？一张图看懂常规转录组和单细胞转录组的区别

常规转录组看一群细胞的整体平均，单细胞转录组分群看每类细胞分别表达什么。基因升高=细胞变多…

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云生信学生物信息学 · 2026-10-13

用 GWAS、eQTL 和单细胞分析，解决“位点附近多个基因，先验证谁”的问题

GWAS 找到显著位点后，最近的基因未必最值得先验证。这个脱敏案例展示如何结合遗传精细定位、eQ…

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单细胞分析 · 2026-10-09

几万个细胞为什么不等于几万个样本？单细胞伪重复怎么改

做疾病组与对照组的推断时，同一供体里的细胞不能简单当成完全独立的受试者。先明确比较单位，…

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单细胞分析 · 2026-10-08

审稿人不认可单细胞注释：只补一张 marker 图够不够？

单个 marker 阳性不是细胞身份的充分证据。把成组标志、排他性信号、样本分布和参考映射放在一…

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