已有数据，
需要深入研究。
围绕单细胞、空间转录组、多组学及相关研究问题，评估分析路径、预期交付和后续验证方向。
了解定制分析关于云生信 / BIOCLOUDSERVICE
研究有问题，
我们一起找到下一步。
生物信息学定制分析 · 科研算力 · 系统培训
云生信是我们的生物信息学服务品牌。面向科研人员与团队，从梳理分析问题、配置计算环境，到学习方法与解读结果，提供与你当前任务相匹配的支持。
WHAT WE DO
选择支持，从你要解决的问题开始。
需要有人做分析、需要计算环境，或希望自己掌握方法，都有对应的入口。
已有数据，
已有任务，
需要合适环境。
根据数据规模、软件和使用方式选择云端计算资源，咨询环境配置、软件安装与使用支持。
测算服务器配置想自己做，
需要系统学习。
从基础工具到单细胞、空间组学与研究方法，通过课程和实操建立分析能力，具体课程权益见课程说明。
浏览课程内容也可以先试试在线工具。从一个具体任务开始，了解云生信的分析工具与技术内容。
进入在线工具RESEARCH IN PRACTICE
从一张图谱，走向一个好问题。
下面用两个方案示例，说明如何连接研究问题、分析路径与预期交付。
01 / 空间转录组
从空间图谱，
寻找肿瘤复发相关线索。
已有空间转录组和病理资料，希望了解：肿瘤边缘的细胞如何聚集，这些空间结构是否与侵袭、免疫逃逸及复发有关？
适用数据 空间转录组、组织图像与病理分区；结合患者分期、复发信息，条件允许时加入单细胞参考。
图为分析思路示意，不代表已观察到的项目结果。
预期交付，让后续研究有据可循
01
空间图谱
关键区域、细胞分布、空间距离与邻近关系。
02
候选机制
与复发相关的空间生态位及候选互作信号。
03
验证建议
候选标志物及免疫组化、多重免疫荧光验证思路。
查看详细分析路径与交付边界
- 定位组织区域
结合切片图像、病理标注和表达数据，识别肿瘤核心、侵袭边缘、免疫聚集区及其他关键区域。
- 构建空间生态位
估计细胞组成，分析相邻位置的细胞组合与临床表型的关联。
- 量化距离与边界
比较细胞状态与肿瘤边界、血管或免疫聚集区的空间关系。
- 筛选候选空间互作
在数据分辨率允许的范围内，结合空间邻近、配体—受体和下游基因程序筛选候选信号。
- 提炼可验证指标
筛选生态位面积、密度、邻近关系及可用于病理染色的标志物组合。
- 评估跨患者稳定性
根据样本条件开展患者间重复分析、区域重采样及独立切片验证。
| 基础分析内容 | 可进一步深挖的问题 |
|---|---|
| 空间聚类与细胞映射 | 哪些局部细胞组合与复发相关？ |
| 表达与通路变化 | 信号是否集中于特定组织边界？ |
| 空间结果图 | 能否形成可进一步验证的结构指标？ |
具体范围取决于患者数量、空间分辨率和临床资料完整性。空间邻近及统计关联用于提出候选假设，不等同于因果机制；验证建议不代表已完成实验验证。
想了解你的空间数据能挖掘到哪一步？
咨询空间分析方案02 / 单细胞转录组
从细胞状态，
探索免疫治疗无应答线索。
已有治疗前后配对的单细胞数据，希望解释：为什么患者疗效不同，哪些细胞状态与信号可能参与无应答，以及如何进一步验证？
适用数据 治疗前后配对单细胞数据、应答分组与患者临床资料；条件允许时加入随访或外部验证数据。
图为分析思路示意，不代表已观察到的项目结果。
预期交付，从图谱走向研究假设
01
疗效相关状态
患者层级的组成变化及关键细胞功能状态。
02
候选信号链
肿瘤与免疫细胞间的候选机制及标志物组合。
03
实验验证路径
染色、流式或表达验证建议，以及独立队列验证方向。
查看详细分析路径与交付边界
- 患者层级的组成比较
以患者为统计单位，结合配对设计比较治疗前后及疗效组间变化，评估患者间一致性。
- 识别细胞功能状态
利用基因程序、主题模型或状态评分，识别免疫抑制、耗竭、记忆、应激等候选状态。
- 关联肿瘤与免疫状态
在患者层级分析恶性细胞转录程序与免疫微环境的联系，并结合临床表型解释。
- 筛选候选互作机制
结合发送细胞的配体表达、接收细胞的受体与靶基因程序，以及疗效关联筛选候选信号。
- 检验标志物稳定性
根据患者数量开展留一患者验证、重采样或外部验证，区分个体特征与较稳定的候选发现。
- 规划后续验证
提出免疫组化、多重免疫荧光、流式或靶向表达验证建议；必要时规划共培养、干预及独立队列研究。
| 基础分析内容 | 可进一步深挖的问题 |
|---|---|
| 细胞聚类与注释 | 哪些功能状态与患者疗效相关？ |
| 配体—受体推断 | 信号、靶基因与功能状态是否一致？ |
| 候选基因筛选 | 跨患者是否稳定，如何开展独立验证？ |
具体交付按样本量、配对情况和资料完整性确定。轨迹或 RNA velocity 仅在数据条件适合时考虑，推断方向不等于因果。标志物为研究候选，不直接作为临床决策依据。
已有单细胞结果，想进一步连接疗效与机制？
咨询单细胞深度分析DEVELOPMENT & SUPPORT
技术积累，也体现在具体的支持里。
了解我们的部分软件研发成果，以及客户在实际使用中得到的帮助。
计算机软件著作权
自动化绘制基因景观软件
上海日之芒信息科技有限公司
2025SR0491189查看证书原图 ↗
计算机软件著作权
自动化孟德尔随机化统计功效计算软件
上海日之芒信息科技有限公司
2025SR0491191查看证书原图 ↗
计算机软件著作权
单细胞RNA-seq全流程自动分析软件
济南领基生物科技有限公司
2025SR1165444查看证书原图 ↗以上为部分软件著作权登记证书，分别标注权利主体；软件著作权与专利为不同类型的知识产权。
遇到报错，一起定位原因。
客户服务记录中，技术人员围绕 R 绘图设备关闭、Seurat 及相关包版本等问题提供排查建议，客户随后反馈问题解决。
依据客户沟通记录整理，已省略个人信息。“主要是你们的服务做得好，对我这种新手比较友好。”
客户资料中也记录了向其他研究人员推荐服务的反馈。
节选自客户反馈；个别体验不代表所有项目结果。BRAND & BUSINESS
认识云生信背后的业务主体。
云生信是品牌名。我们围绕生信分析、计算环境与培训提供服务，具体签约、开票主体及服务范围在合作前确认。
上海日之芒信息科技有限公司
生物信息学定制分析、课程培训与软件研发。
济南领基生物科技有限公司
主要承担服务器业务。
办公地址
上海市闵行区龙湖蓝海引擎科创中心806室
WORK WITH US
先把需求说清楚，再确定如何合作。
不必先决定技术路线，先告诉我们你的数据、目标和当前卡点。
- 01
说明需求
研究目标、数据类型、样本规模与时间要求。
- 02
评估与报价
沟通可行路径，明确范围、费用和预计周期。
- 03
执行与交付
按约定开展工作，交付结果、文件及说明。
- 04
解释与支持
按约定提供结果解释、使用排查与后续支持。
咨询时，需要先准备哪些信息？
提供研究目标、数据类型、患者或样本数量、已有分析结果及希望解决的问题即可。首次咨询可先描述数据情况，无需直接发送完整敏感数据。
能否按示例直接获得相同发现？
两个示例展示分析思路，不是已完成的客户项目。可实施的方法、交付内容和能支持的结论取决于数据质量、样本量与研究设计，先评估后确认。
把你的研究问题，
带来聊一聊。
带上数据类型、研究目标和当前困难，开始一次有针对性的沟通。
售后与投诉 如服务过程中遇到问题，可联系 19921126010。
付款前请核对公司收款信息；发现销售个人收款，可通过上述渠道反馈。