组织和细胞所处的力学环境，会直接影响黏附、迁移、增殖、分化以及细胞外基质重塑。对于肿瘤、纤维化、骨与软骨、生物材料和组织工程等研究来说，基质刚度（matrix stiffness）已经成为一个越来越常见的分析方向。
为了方便大家开展转录组和单细胞数据分析，我们整理了一份基质刚度相关候选基因集。表格包含 1,418 条基因记录，按原始符号去重后为 1,417 个候选基因，可作为后续筛选和功能分析的起点。
这份基因集包含哪些方向？
基因集覆盖了多类与细胞力学响应相关的分子，例如细胞外基质与胶原家族、整合素与黏附斑信号、肌动蛋白骨架调控、基质降解与重塑、TGF-β 信号、机械敏感离子通道，以及炎症和细胞迁移相关分子。表格中可见 COL、LAMA、ITGA/ITGB、MMP、LOX/LOXL、TGFB、PTK2、ROCK、PIEZO1 等代表性基因或家族。
可以怎么用？
- Bulk RNA-seq：使用 GSVA、ssGSEA 等方法计算样本的基质刚度相关评分，并比较不同分组。
- 单细胞转录组：使用 UCell、AUCell 或 AddModuleScore，观察不同细胞类型及细胞亚群的力学响应差异。
- 差异基因筛选：将差异表达基因与本基因集取交集，再结合 GO、KEGG、PPI 等结果缩小候选范围。
- 课题设计：围绕细胞外基质重塑、机械转导、迁移侵袭或纤维化等方向构建分析线索。
使用前需要注意
这是一份用于研究探索的候选基因集合，不等同于已经在所有组织、疾病和实验条件中验证过的固定标志物。基质刚度的生物学效应具有明显的组织、细胞类型和疾病背景差异。正式分析前，建议根据研究物种统一基因符号、去重，并结合差异表达、通路富集和文献证据进一步筛选。
基因集下载：点击下载基质刚度相关候选基因集（Excel）
需要进一步分析？
如果你希望把这份基因集用于 Bulk RNA-seq、单细胞转录组、空间转录组、富集分析或机器学习筛选，可以把研究方向、物种和数据类型发给我们。我们可以协助完成基因符号整理、评分分析、分组比较、结果可视化和分析方案设计。