用Boltz-2筛候选分子，别只盯着一个分数

面对一批候选分子，最想问的通常是：“先研究哪几个？”如果交付只剩一张排名表，分数怎么来的、能回答什么、哪些结果需要谨慎，往往还得重新追问。

找人做 Boltz-2 分析，值得先约定的是交付内容和解释范围。这样结果拿到手，才方便继续讨论和验证。

结构可信度和结合评分，回答的是不同问题

结构看起来合理，不代表一定结合；模型给出较高的结合可能性，也不能直接当成实验成功概率。选候选时，需要把结构、评分、输入是否适用以及已有证据放在一起判断。

官方输出说明区分了结合可能性与亲和力相关预测：前者用于区分潜在结合分子和非结合分子；后者更适合比较活性分子及其改造。不要把所有分子只按一个数字排序，就写成“已证实高亲和力”。

这里讨论的是小分子与蛋白靶点的亲和力预测。不能直接把同一解释套到蛋白—蛋白、抗体或核酸体系。

委托之前，把三件事约定好

第一，核对输入。蛋白序列或构建体是否对应研究对象，分子结构是否明确，有没有可用于对照的已有结果。示例场景是“同一靶点下比较一批候选”，并非承诺任何项目都会得到有效命中。

第二，列出交付物。可以沟通结构文件、评分汇总、必要的置信度信息、软件与模型版本、参数和运行记录，并说明失败或不适用的输入如何处理。这是一份交付沟通清单，最终按项目约定执行。

第三，说清解释做到哪一步。哪些候选值得优先复核，哪些地方证据不足，后续需要什么实验，应保留明确区分。计算评分用于研究参考，不承诺筛出有效药物或得到预期结论。

和云生信合作，可以选哪种方式？

三种方式按实际任务沟通，部署、分析与租赁分别确认范围和费用；资源可用性、开通或交付时间以双方确认的方案为准。

先把你的任务说清楚

如果你想先判断这批候选怎么分析，可以选择“单独委托我们分析”，说明靶点类型、分子数量、已有数据、想回答的问题和期望时间。云生信先沟通适用性与交付清单，再确认分析范围、费用和排期。

下一篇留给想自己动手的人：怎样按任务选择服务器，也把“20秒一次预测”看明白。