S03 · 标准服务

bulk RNA-seq 标准分析

围绕一个主要比较完成输入检查、样本质控、差异表达、基础功能分析、图表、全量结果和可复现记录。

预计周期
5—7个工作日
基础范围
人或小鼠;1个队列;最多24个样本;2组;1个主要比较
默认修改
1轮已有结果的图表与说明调整

适合

这些情况可以进入基础包

  • 已有未标准化基因计数矩阵或可规范导入的定量文件
  • 分组、样本对应和主要比较已经明确
  • 需要一套边界清楚的基础转录组结果

不适合直接下单

这些情况需要先评估

  • 只有图片、筛选后的基因表,且没有可用表达矩阵
  • 复杂时间序列、多队列整合或多个主要研究目标
  • 希望通过反复更换阈值和方法制造显著结果

开始前

客户需要准备什么

资料不完整时会先列出缺项;补齐并确认范围后,才进入服务周期。

01

未标准化的基因计数矩阵,或签单前确认可导入的转录本定量文件

02

样本信息表:样本编号、组别、批次、配对关系等

03

物种、参考基因组及注释版本,已知时必须提供

04

明确的比较方向和预先约定的筛选标准

05

关注基因或通路清单,若有

执行内容

基础包会完成

  • 输入格式、样本对应关系和计数特征检查
  • 低表达过滤、标准化和样本相关性评估
  • PCA 与异常样本提示;剔除样本需有依据并记录
  • 1个主要比较的差异表达分析
  • 火山图、热图和基础表达展示
  • 约定的 GO 与一种通路数据库的基础功能分析

交付文件

你会收到

  • 分析报告.html 或 PDF
  • 样本质控表.xlsx
  • 差异分析全量结果.tsv
  • 功能富集结果.xlsx
  • 标准化表达矩阵.tsv
  • figures/ 图表目录
  • scripts/、参数和环境版本说明
验收方式

分组与确认单一致,全量结果能与图表对应,方法说明与实际执行一致,核心结果可在约定环境下复现。无显著差异或富集时仍完整交付并解释限制。

范围外需求

出现这些情况,先确认加项或转定制。

已有工作能够复用时,会在变更说明中写清,不重复计算已完成的同一项工作。

FASTQ 质控、比对或定量

新增样本、比较、重新分组或改变统计模型

多队列整合、复杂时间序列或交互效应

生存、预测模型、网络分析或机制专题

修改规则

一轮修改,不等于一个小问题。

指定联系人在首次交付后5个工作日内集中提交反馈。公司交付错误免费纠正,不占修改次数。

免费纠正

与确认范围不一致

分组、脚本、文件或结果对应关系出现错误时,由团队负责纠正。

本产品包含

1轮已有结果的图表与说明调整

围绕原输入、原任务和原交付完成,不改变研究问题和统计设计。

另行报价

新增数据、比较或方法

先出变更说明、费用和新增周期,经确认后再执行。

其他标准服务

S01公共数据可用性检查S02研究课题与分析路线评估S04单细胞质控、注释和基础下游分析S05审稿返修分析包S06生信环境诊断与任务试跑

提交资料做适配判断

先把任务边界说清楚。

这里只收任务摘要和联系方式,不上传研究数据。提交后会生成申请编号;需要文件时,再使用双方确认的安全方式。

  • 核对最接近的标准服务
  • 指出启动前还缺什么资料
  • 确认基础包、加项或定制范围

也可以直接联系企业微信客服 ↗

下一步

把当前资料发来,先确认是否适合基础包。

请说明研究问题、数据类型、样本或任务规模和希望交付的结果。涉及敏感研究数据时,使用双方确认的安全上传方式。

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