S04 · 标准服务

单细胞质控、注释和基础下游分析

从合格计数矩阵出发,完成按样本质控、降维聚类、主要细胞类型注释、marker 和基础组成展示。

预计周期
10—15个工作日
基础范围
人或小鼠;1项研究;最多8套建库矩阵、8个生物学样本、合计10万输入细胞
默认修改
1轮原注释层级内的复核与图表调整

适合

这些情况可以进入基础包

  • 已有 10x 等格式的计数矩阵和样本元数据
  • 需要先建立基础细胞图谱,再决定深度下游
  • 接受对证据不足的群体保留待定或粗层级名称

不适合直接下单

这些情况需要先评估

  • 只有无法确认数据层的 RDS 文件
  • 需要空间、多组学、跨平台大规模整合
  • 要求每个 cluster 必须命名或保证发现稀有亚群

开始前

客户需要准备什么

资料不完整时会先列出缺项;补齐并确认范围后,才进入服务周期。

01

计数矩阵以及基因、细胞条码文件,或经确认可用的分析对象

02

样本、供体、分组、批次和建库信息

03

组织来源、处理条件与已知细胞类型背景

04

已有测序或上游处理质控报告

05

最多10个预先约定的关注基因

执行内容

基础包会完成

  • 输入与元数据一致性检查
  • 按样本评估质量并记录过滤依据
  • 双细胞评估和约定处理
  • 标准化、降维、聚类;有依据时进行约定的批次处理
  • 主要细胞类型注释及 marker 展示
  • 按样本展示细胞组成和约定关注基因

交付文件

你会收到

  • 单细胞基础分析报告.html
  • 各样本质控汇总.xlsx
  • cell_metadata.tsv.gz
  • 注释依据与不确定性.xlsx
  • cluster_markers.tsv
  • 各样本细胞组成.xlsx
  • 一种约定格式的分析对象
  • 图表、脚本、参数与环境版本清单
验收方式

质控过程有记录,注释有依据且保留不确定性,细胞与样本对应正确,交付对象可读取,图表与表格一致。基础包不承诺一定发现新亚群。

范围外需求

出现这些情况,先确认加项或转定制。

已有工作能够复用时,会在变更说明中写清,不重复计算已完成的同一项工作。

FASTQ 到计数矩阵的上游处理

超出规模上限或跨平台整合

指定细胞群再聚类与精细注释

样本级组间差异、轨迹、细胞通讯、调控、CNV、空间或多组学

修改规则

一轮修改,不等于一个小问题。

指定联系人在首次交付后5个工作日内集中提交反馈。公司交付错误免费纠正,不占修改次数。

免费纠正

与确认范围不一致

分组、脚本、文件或结果对应关系出现错误时,由团队负责纠正。

本产品包含

1轮原注释层级内的复核与图表调整

围绕原输入、原任务和原交付完成,不改变研究问题和统计设计。

另行报价

新增数据、比较或方法

先出变更说明、费用和新增周期,经确认后再执行。

其他标准服务

S01公共数据可用性检查S02研究课题与分析路线评估S03bulk RNA-seq 标准分析S05审稿返修分析包S06生信环境诊断与任务试跑

提交资料做适配判断

先把任务边界说清楚。

这里只收任务摘要和联系方式,不上传研究数据。提交后会生成申请编号;需要文件时,再使用双方确认的安全方式。

  • 核对最接近的标准服务
  • 指出启动前还缺什么资料
  • 确认基础包、加项或定制范围

也可以直接联系企业微信客服 ↗

下一步

把当前资料发来,先确认是否适合基础包。

请说明研究问题、数据类型、样本或任务规模和希望交付的结果。涉及敏感研究数据时,使用双方确认的安全上传方式。

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