直接判断:单细胞 RNA 测序只能提供转录层面的代谢和调控线索。应按细胞类型与供体分层,并避免把乳酸化分数当作直接修饰测量。
适用条件
已有 scRNA-seq 数据,想定位乳酸化相关细胞状态。
建议按这个顺序检查
- 先检查乳酸代谢和转运基因的检测率。
- 使用预定义且分层的基因集做 UCell 等排序型评分。
- 在细胞类型内比较,并以供体作为推断单位。
- 结合组织来源、缺氧、糖酵解和免疫状态解释。
已知限制
掉零、测序深度和细胞组成会显著影响分数;不能由单细胞表达直接定位修饰位点。
依据与版本
- Bioconductor UCell(Bioconductor release)
- 乳酸化原始研究:Metabolic regulation of gene expression by histone lactylation(Nature 2019)