直接判断：三类数据分别回答表达响应、乳酸背景和修饰位点问题。应围绕同一比较和时间点连接，而不是只取共同变化。
适用条件
拥有两种以上组学，准备构建乳酸化机制证据链。
建议按这个顺序检查
- 先定义同一处理、组织和时间窗口下的核心问题。
- 转录组报告代谢与下游响应，代谢组报告乳酸及相关代谢物。
- 修饰蛋白组报告位点和相对丰度，并检查定位置信度。
- 用干预或时间顺序检验三层证据是否支持同一方向。
已知限制
相关变化同时出现不等于因果链成立；不同批次样本和不同时间点不能无条件拼接。
依据与版本
- 乳酸化原始研究：Metabolic regulation of gene expression by histone lactylation（Nature 2019）
- PRIDE 蛋白质组数据仓库（EMBL-EBI PRIDE）