基础与证据 · S01

spot、bin、细胞分割和单细胞分辨率有什么区别?

它们是不同的空间测量单位。spot 或 bin 可能包含多个细胞;分割得到的 cell 也依赖图像与算法,不能自动等同于真实单细胞测量。

直接判断:它们是不同的空间测量单位。spot 或 bin 可能包含多个细胞;分割得到的 cell 也依赖图像与算法,不能自动等同于真实单细胞测量。

适用条件

准备比较 Visium、Visium HD 或其他空间平台的输出。

建议按这个顺序检查

  1. 先记录平台、实验化学版本和原始空间单位。
  2. 确认表达矩阵列对应 spot、bin 还是分割细胞。
  3. 把空间坐标、图像分割和表达归属的误差分开评估。
  4. 在方法和图注中使用准确的数据单位。

已知限制

不同平台的分辨率、灵敏度和覆盖范围不可只用“单细胞”一个标签比较。

依据与版本

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