分析方法 · S04

多个切片怎样整合,才不会抹掉真实空间差异?

先区分切片、个体、批次和生物条件,再决定是否校正。整合用于对齐可比结构,不应强迫不同组织区域完全重合。

直接判断:先区分切片、个体、批次和生物条件,再决定是否校正。整合用于对齐可比结构,不应强迫不同组织区域完全重合。

适用条件

拥有多个切片、样本或批次,需要联合聚类和比较。

建议按这个顺序检查

  1. 建立切片—个体—条件—批次元数据表。
  2. 先分别质控和探索,再判断差异来源。
  3. 只在可比细胞或组织域内评估整合。
  4. 保留未整合结果和样本级统计作为敏感性分析。

已知限制

批次与条件完全重合时,算法无法从数据中识别二者各自贡献。

依据与版本

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