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云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-01-29 单细胞测序分析（六）Seurat寻找marker基因以及细胞鉴定 上一期小果使用了三种降维算法对单细胞数据进行了降维和聚类，将2700个细胞分成了9个细胞亚群。… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-01-25 纯代码实操，小果带你计算基因与免疫细胞在TMB中的相关性 我们大家知道基因与多种免疫细胞类型之间有着相关性，那么了解指定基因与免疫细胞类型之间的相… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-01-25 单细胞测序分析（五）R包Seurat三种算法对数据聚类降维 大家好，小果今天继续介绍R包Seurat单细胞测序分析。 上一期我们用Seurat对数据进行了进一步的… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-01-25 学会CMplot，绘制出比qqman更优秀的GWAS可视化结果 在最近的这段时间里相信做科研的各位小伙伴都被GWAS和孟德尔随机化刷过屏，小果也有在做教学的… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-01-25 testing-based procedures减少变量简化模型预测结果的好帮手 在统计假设检验中，testing-based procedures是一类常用的方法，用于在生物信息数据学中进行 [&… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-01-25 保姆级教程！！小果教你学习曼哈顿图！Manhattan图！！ 有的小伙伴可能听说过曼哈顿图，但是并不了解，也不知道是来做什么的，其实，曼哈顿因为其形似… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-01-25 敲黑板！！小果教你学习R包-ggalluvial，绘制炫酷的桑基图（Sankey）！！ 小伙伴平时面对多个数据关系不知道如何绘制图，一般来说使用常见的表格已经满足不了小伙伴，并… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-01-25 只需三分钟！小果教你在绘制的热图添加注释信息！！ 有不少小伙伴在绘制热图时候，绘制的图信息很少，只有名称和相关性值，有时看起来枯燥乏味。小… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-01-25 单细胞测序分析（四）R包Seurat下游分析 上一期小果用loupe brosew进一步探索单细胞测序处理结果，但是它的功能有限，还无法实现复杂的… 阅读全文 ›