直接判断:基因数取决于数据库版本、角色筛选、物种和去重规则。应保存从原始记录到最终命中基因的完整数量链。
适用条件
准备使用文献或数据库基因列表做富集、评分、聚类或建模。
建议按这个顺序检查
- 记录数据库或论文的版本与访问日期。
- 区分调控因子、标志物和仅有相关性的候选,不机械合并。
- 完成物种与基因 ID 映射并保留一对多处理规则。
- 输出原始条目、筛选后、去重后及表达矩阵命中的数量。
已知限制
数据库收录代表文献证据被整理,不代表该基因在当前组织和处理条件中具有同样作用。
依据与版本
- FerrDb V3:22 类调控性细胞死亡资源(FerrDb V3 / 2025)
- 铜死亡原始研究:Copper induces cell death by targeting lipoylated TCA cycle proteins(Science 2022)