结果排查 · C05

铜死亡评分与线粒体代谢结果方向相反,应该怎样排查?

先核对基因集方向、输入层和细胞组成,再区分“铜死亡易感背景”与“铜死亡已经发生”这两个不同问题。

直接判断:先核对基因集方向、输入层和细胞组成,再区分“铜死亡易感背景”与“铜死亡已经发生”这两个不同问题。

适用条件

铜死亡分数、OXPHOS/TCA 富集、线粒体比例或实验方向不一致。

建议按这个顺序检查

  1. 列出每个分数的基因、方向和输入矩阵。
  2. 检查是否把促进、抑制和标志基因合成一个无方向分数。
  3. 分细胞类型或样本组成复算,排除组成效应。
  4. 把呼吸依赖性解释为易感背景,不把它直接写成死亡事件。

已知限制

不同指标可能测量不同时间点和生物层级,方向不一致不一定是技术错误。

依据与版本

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