Space Ranger 和空间下游分析需要多少内存与存储？

直接判断：资源取决于 assay、FASTQ 规模、参考、切片数、bin 分辨率和是否保留 BAM。应先用一个代表性样本试跑，再按峰值和并发扩展。

适用条件

准备部署 Space Ranger 或进行多切片、Visium HD 下游分析。

建议按这个顺序检查

1. 记录平台版本、FASTQ 大小、参考和预期输出。
2. 单样本试跑并测量 CPU、内存、临时与最终存储峰值。
3. 明确是否生成 BAM 以及需要保留多久。
4. 下游避免把大稀疏矩阵无意转换成稠密矩阵。

已知限制

只按 spot 或 cell 数无法精确估算资源；软件版本和参数会改变输出与峰值。

依据与版本

• 10x Genomics Space Ranger 官方文档（Space Ranger 4.1）
• Space Ranger 输出文件说明（Space Ranger 4.1）