直接判断：还要检查组织与捕获区域对齐、背景、空间覆盖、测序饱和度、线粒体/核糖体信号、分割质量和切片间一致性。
适用条件
Space Ranger 已完成，准备进入聚类和差异分析。
建议按这个顺序检查
- 检查 web_summary、组织图和 fiducial/alignment 结果。
- 在空间图上查看 UMI、基因数及质量指标分布。
- 识别组织边缘、空白区、坏点和异常高背景。
- 按切片分别质控，保留排除规则和前后数量。
已知限制
统一阈值不适合所有组织与平台；高线粒体比例可能来自生物学或组织处理，需要结合空间位置判断。
依据与版本
- 10x Genomics Space Ranger 官方文档（Space Ranger 4.1）
- Bioconductor SpatialExperiment（Bioconductor release）