研究设计 · S06

空间点很多,为什么仍然不能把每个 spot 当独立样本?

同一切片中的位置共享个体、处理和空间相关性,不是独立生物学重复。组间推断应回到个体或独立切片设计。

直接判断:同一切片中的位置共享个体、处理和空间相关性,不是独立生物学重复。组间推断应回到个体或独立切片设计。

适用条件

准备做组间差异、相关分析或机器学习,spot 数远大于样本数。

建议按这个顺序检查

  1. 明确生物学重复单位是个体、组织块还是切片。
  2. 在模型中考虑样本层级和空间相关性。
  3. 避免随机拆分相邻 spot 造成训练测试泄漏。
  4. 报告样本数与空间单位数,而不是只报总 spot。

已知限制

更多空间位置提高组织内分辨率,但不能替代更多独立个体。

依据与版本

带着我的条件继续提问 →