论文里的SRA accession号是什么?它是SRA(测序数据归档库)中记录的唯一登录号,用来定位研究、样本、实验或测序运行。前缀不同,代表的层级也不同。
| 常见前缀 | 代表什么 | 有什么用 |
|---|---|---|
| SRP | 研究项目 | 查找项目关联数据 |
| SRS | 样本 | 核对样本信息 |
| SRX | 实验 | 查看文库与测序设计 |
| SRR | 测序运行(Run) | 定位具体运行数据 |
下载时通常整理SRR列表,再用prefetch获取数据、fasterq-dump转换FASTQ。一个样本可能对应多个SRR,不能把SRR数量直接当作样本数。拿到项目号后,可通过SRA Run Selector筛选并导出运行编号。
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参考:NCBI编号说明、Run Selector、下载指南。