先看结论:配置应由完整任务链决定,不只看样本数或细胞数。先列出输入文件、对象大小、主要步骤、并行人数和可接受时间,再通过代表性任务测峰值,给出够用、推荐和扩展三档方案。
适用情况
准备运行 bulk、单细胞或联合分析,希望估算 CPU、内存、存储、GPU 和使用周期。
建议按这个顺序检查
- 记录数据类型、原始文件体积、样本/细胞数、当前对象大小和预计增长。
- 列出真正会运行的步骤:比对、整合、评分、CellChat、SCENIC、轨迹、模型或绘图。
- 说明软件版本、并行人数、是否需要同时保存原始与中间文件,以及希望多久完成。
- 先用一个代表性任务试跑,记录峰值内存、CPU、临时磁盘和耗时。
- 根据试跑给出三档配置和升级路径,不承诺某个固定内存对所有流程都不会 OOM。
不能从当前结果直接得出什么
网站测算只能给范围。代码实现、矩阵稀疏性、并行设置、缓存和临时文件都会影响资源;最终配置应以代表性任务试跑和实际并发为准。
依据与版本
- Seurat v5 大规模数据工作流Seurat v5
- 云生信服务器配置测算官网当前入口
最后核验:2026-10-10|资料核验:公开来源核对