
拿到一个表达矩阵,后面就能直接做单细胞分析?还要知道它来自哪些样本、用了哪个参考,以及运行过程中出现过什么质控信号。
先约定交付物,再开跑
矩阵是后续工作的入口。建议同时约定质控报告、样本对应表、参考版本和运行记录。可选云端功能还可能涉及外部数据传输,是否启用要在执行前说清楚。
| 先核对什么 | 准备哪些信息 |
|---|---|
| 输入对应 | 样本名、文库类型与FASTQ清单 |
| 结果资料 | 矩阵、质控报告及约定的附加输出 |
| 版本与范围 | Cell Ranger、参考包版本;是否包含下游分析 |
原始数据处理和下游研究分开约定
比对计数完成,不等于细胞注释或机制研究已经完成。已有下游能力的团队可以租环境自己跑;缺执行时间的团队,可以委托这一段处理,后续工作再按需求沟通。
技术参考:Cell Ranger官方系统要求。按实际软件版本核对。
和云生信合作,选适合你的方式
我们部署:在我们的服务器上配置并交接环境。我们分析:单独委托,按约定交付结果与说明。你来操作:租用服务器,自行执行分析。
需要Cell Ranger处理或部署,把样本数、文库类型和期望交付发来。云生信先确认数据与流程适配,再沟通资源、交付内容和费用。
配置、资源、费用、排期与服务范围先确认;软件及数据许可按用途核对。首次只需任务概况,不用上传原始或敏感数据。
Cell Ranger 合作咨询 选择部署、委托分析或租服务器自行操作,说明任务目标和规模,我们先沟通适用性与服务范围。 也可以直接联系企业微信客服,发送“Cell Ranger 合作咨询”。这项分析,你希望怎样合作?