
FASTQ已经下载好,流程却迟迟跑不完。打开任务管理界面,发现问题可能出在内存,也可能是临时盘快满了。Cell Ranger的资源准备,需要一起看。
最低要求不是所有项目的配置单
截至本次核对,官方v10.1系统要求列出64GB内存、推荐128GB,并提醒更大数据需要更多资源。这是版本对应的起点,不是给每批数据统一配128GB的理由。
| 先核对什么 | 准备哪些信息 |
|---|---|
| 实验与数据 | 文库类型、样本数、读段规模和物种 |
| 运行条件 | 软件版本、参考包与目标流程 |
| 存储安排 | 输入、临时文件和输出各有多少空间 |
一批样本别急着同时启动
先确认单任务资源,再安排并发。多个任务共用一台服务器时,线程、内存和磁盘读写都需要分配。开更多任务,并不自动代表整批完成得更早。
技术参考:Cell Ranger官方系统要求。按实际软件版本核对。
和云生信合作,选适合你的方式
我们部署:在我们的服务器上配置并交接环境。我们分析:单独委托,按约定交付结果与说明。你来操作:租用服务器,自行执行分析。
把文库类型、数据规模、版本和计划开始时间发给云生信。我们据此沟通CPU、内存、工作盘与使用周期,先把运行条件配齐。
配置、资源、费用、排期与服务范围先确认;软件及数据许可按用途核对。首次只需任务概况,不用上传原始或敏感数据。
Cell Ranger 合作咨询 选择部署、委托分析或租服务器自行操作,说明任务目标和规模,我们先沟通适用性与服务范围。 也可以直接联系企业微信客服,发送“Cell Ranger 合作咨询”。这项分析,你希望怎样合作?