云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-02-21 一文学会利用scMetabolism 包进行单细胞代谢活性分析 今天小果想带着小伙伴一起学习如何利用scMetabolism R包进行单细胞代谢活性的分析,该包可以对… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-02-20 利用棒棒糖图展示单细胞marker基因表达量 今天小果想用棒棒糖图来展示单细胞marker基因在不同细胞群里的表达量情况,展示出的效果非常不… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-02-18 绘制单细胞分析组织中细胞数量和细胞比例柱状图 今天绘制一下单细胞分析结果组织中细胞数量和细胞比例柱状图,代码如下: 安装需要的R包 instal… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-02-06 想提高单细胞注释准确度?“手动校正+验证分析”必不可少! 在进行单个细胞水平的分析时,单细胞转录组测序技术是非常便利高效的一种技术,它可以通过测量… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-02-06 单细胞表型预测黑科技!3分钟带你解锁ScPP完全体!! 单细胞分析一直是生信以及医学期刊比较流行的方向,小果在浏览期刊的时候发现了这样一个R包—ScP… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-02-02 单细胞转录组分析神器!3分钟带你用Seurat揪出肿瘤“致命基因”! 在生信分析的过程中,Seurat一直是我们的“传家宝”,是一个用于单细胞转录组数据分析的R语言包,… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-02-02 空间转录组新利器!MIA分析带你巧妙“拆解”细胞类型!! 随着癌症的空间转录组分析的爆火,越来越多的肿瘤学TOP期刊收录了相当一部分的生信分析文章,很… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-02-02 scMerge2魔法指南:小果带你领略单细胞数据融合的奇妙之旅! 前言 单细胞多样本整合工具大家也学过很多了吧!但是除了 Seurat、SAUCIE 和 Scanorama 之 [&he… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-02-02 CCPlotR: 可视化细胞间相互作用(scRNA-seq) 今天小果要分享的新鲜好包是2023年9月20日发表于Bioinformatics Advances上用于可视化 [&hellip… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-01-31 超简单!使用spaceranger做空间转录组分析 今天小果带大家使用spaceranger进行空间转录组的分析。 空间转录组简介 传统的单细胞测序,是将… 阅读全文 ›