云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-01-31 拟时序分析不会做？R包Monocle3来解决 今天小果来为大家介绍细胞拟时序分析以及如何使用monocle3做细胞拟时序分析。 那么什么是细胞拟… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-01-29 从小白到空转达人：小果教你用Scanpy包玩转前沿热点空间转录组分析！ 大家好呀，我们又见面啦，今天和大家聊聊单细胞和空转分析中一个很基础的包——Scanpy，Scanpy 是… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-01-29 单细胞测序分析（六）Seurat寻找marker基因以及细胞鉴定 上一期小果使用了三种降维算法对单细胞数据进行了降维和聚类，将2700个细胞分成了9个细胞亚群。… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-01-25 单细胞测序分析（五）R包Seurat三种算法对数据聚类降维 大家好，小果今天继续介绍R包Seurat单细胞测序分析。 上一期我们用Seurat对数据进行了进一步的… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-01-25 单细胞测序分析（四）R包Seurat下游分析 上一期小果用loupe brosew进一步探索单细胞测序处理结果，但是它的功能有限，还无法实现复杂的… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-01-24 SCP探索单细胞宇宙的魔法工具，加速生物信息学研究 在之前，小果为大家介绍了popsicleR这个令人惊叹的R包，它提供了从单细胞分析质控到细胞注释的… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-01-24 10×genomics单细胞测序分析（三）Loupe Browser数据分析探索 上期小果带大家介绍了Cell Ranger处理分析后输出的文件，并解读了网页版的结果报告。虽然从网页… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-01-24 10×genomics单细胞测序分析（二）Cell Ranger结果报告解读 小果上一期带大家进行了单细胞测序分析的实战教学。从环境搭建开始，到下载数据，跑通流程，最… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-01-24 10×genomics单细胞测序分析（一）环境搭建与Cell Ranger数据处理 10×genomics因其分选细胞效果好，通量高等优点已成为主流的单细胞测序平台。 小果上期对它的原… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-01-23 对单细胞分析毫无头绪？让popsicleR领你入门 不知道有多少刚开始接触单细胞测序分析的小伙伴在面对无穷无尽的R包和代码时感到畏难，仿佛一堆… 阅读全文 ›