云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-10-11 没听错吧!单细胞中也可以进行免疫浸润分析?SpatialCells带给你新的体验! 前言 谈起生信分析必备项目免疫浸润分析,小伙伴们再熟悉不过了!像小伙伴们耳熟能详的ImmuCell… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-10-11 空间转录组中的细胞通讯分析你get到了吗?大海哥帮你轻松搞定! 前言 沉浸在暑期快乐时光里的小伙伴们快收收心吧!千万别忘记大海哥的每日小课堂啊!厌倦了游戏… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-10-11 多种单细胞富集评分算法打包到R包irGSEA!批量评分方法减少引入偏差! 前言 小伙伴们都趋向于使用未校正批次效应后的数据进行差异基因分析,但是在富集分析的过程中,… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-10-11 拒绝千篇一律!R包Ragas带你打开单细胞聚类分析及可视化的新大门 前言 今天小果又和大家见面了,跟随小果的步伐来给自己空瘪的皮囊注入点知识的能量吧!接触单细… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-10-11 单细胞注释还能这样玩?PIPET带你通过表型信息预测单细胞数据中的相关亚群 前言 基于特定marker的单细胞亚群注释是不是已经手到擒来、轻松搞定了?是不是想尝试一下新的单… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-09-12 大佬眼中的超级水刊NC照样出佳作!基于核投影的过滤算法 SiFT来揭示单细胞数据隐藏的生物属性 前言 天空一声巨响,大海哥闪亮登场!开始今天的分享之前,小伙伴们竖起耳朵听听大海哥的问题!… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-09-12 终于整理好了!结合特征的单细胞嵌入R包SIMBA全套分析教程+代码送给大家 前言 谈到单细胞分析,少不了的就是聚类!聚类!在聚类!!不幸的是,这些“以聚类中心”分析方法… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-09-12 单细胞测序分析还能怎么卷?Mellon带你了解单细胞分化过程中的细胞密度变化 前言 大海哥在群里看到小伙伴们对于生信分析到底还能不能发SCI讨论的热火朝天!很多小伙伴们@大… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-09-12 细胞通讯分析还在用Cellchat?真的OUT了!ICELLNET 你值得拥有! 前言 天苍苍,野茫茫,一天不分享小果心痒痒!今天跟着小果来看看细胞通讯又有什么新花样了!自… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-09-12 空间转录组学数据处理只依赖R语言?让我们从scanpy开始,拥抱python吧! 前言 空间转录组学分析,是近几年的一个热点。相信小伙伴们对于seurat再熟悉不过了!但是seurat… 阅读全文 ›