云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2026-09-22 空间转录组和单细胞怎么选?先看你缺哪类证据 想知道哪些细胞发生变化,还是变化发生在哪里?从研究问题出发,判断单细胞、空间转录组和联合… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2026-09-17 单细胞分析怎么做?先理清质控、注释与组间比较 从质控指标、细胞注释到样本层面的组间比较,理清单细胞分析的三个关键环节,让结果更便于解释… 阅读全文 ›
单细胞分析 单细胞分析 · 2026-09-12 拿到单细胞测序报告后,如何判断还需要哪些深入分析? 先确认研究问题、基础结果和下一步决策,再选择单细胞深入分析。本文梳理细胞亚群、样本层面比… 阅读全文 ›
单细胞分析 单细胞分析 · 2026-09-11 基质刚度相关基因集整理:1,400+候选基因,适用于转录组与单细胞分析 整理了一份包含1,400多个候选基因的基质刚度相关基因集,可用于Bulk RNA-seq、单细胞转录组、富… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-11-19 用 Augur 找到受扰动影响最大的细胞类型 Augur 单细胞分析实战:从安装、示例运行、AUC 结果解读到可视化,快速定位对疾病、治疗或衰老… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-10-30 单细胞类型鉴定和解释的准确性欠佳?CASCC自适应吸引子算法给你提供额外视角! 前言 小果见面会又要开始了,虽然小果实验很忙,但是看到好用的单细胞聚类R包还是忍不住第一时… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-10-28 空间转录组学数据处理只依赖R语言?让我们从scanpy开始,拥抱python吧! 前言 空间转录组学分析,是近几年的一个热点。相信小伙伴们对于seurat再熟悉不过了!但是seurat… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-10-28 单细胞RNA测序模拟,Splatter包让你的研究飞起来! 嘿,科研小伙伴们,小师妹我又来啦!今天,我要给大家带来一个超级实用的生物信息学工具——Splat… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-10-17 懒人福利!纯干货!Pianno为空间转录组内的空间点自动定义结构或细胞类型 前言 小伙伴们,还记不记得单细胞自动注释工具SingleR?是不是用起来爽爆了!让原本很难得细胞… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-10-11 你还在为单细胞RNA测序数据发愁吗?试试SCONE包,让你轻松轻松校正数据偏差,探索生物学新世界! 大家好!今天我想和大家分享一个专门用于单细胞RNA测序数据标准化和质量控制的R包——SCONE包。通… 阅读全文 ›