转录组分析

单细胞分析 · 2026-10-20

STARsolo 单细胞转录组为什么 16 GB 能建索引，映射时却不稳？服务器资源规划

STARsolo 的稀疏索引可以适配 16 GB 内存，但人类索引共享内存量级约 31 GB、典型哺乳动物索引…

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云生信学生物信息学 · 2026-10-20

样本少时，多测一些能补回来吗？RNA-seq预算先这样分

样本少时，把每个样本测得更深能否补回来？本文区分生物学重复与测序深度解决的问题，并按差异…

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服务器与环境 · 2026-10-15

空间转录组一上机就爆内存？Space Ranger 的 64 GB、128 GB 和 1 TB 该怎么选

Space Ranger 跑不动，不一定缺显卡。结合官方 8 核/64 GB 最低、32 核/128 GB 推荐和 1 TB 磁…

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云生信学生物信息学 · 2026-10-14

生信分析做完了，下一步实验怎么做？

候选基因筛出来了，却不知道先验证谁、实验怎样分组、结果不符合预期怎么办？看看云生信怎样结…

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云生信学生物信息学 · 2026-10-12

生信分析得到几十个候选基因后，如何选出优先验证的两个？

生信分析筛出了几十个候选基因，实验第一步该做谁？云生信用一份方法示例，拆解候选取舍、验证…

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云生信学生物信息学 · 2026-10-12

STAR 比对为什么总卡住？真正的瓶颈，往往不在命令

STAR 比对跑不动，不一定是命令写错。参考索引会占用大量内存，FASTQ 读取、BAM 写入和排序还会…

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云生信学生物信息学 · 2026-10-08

生物学重复和技术重复有什么区别？RNA-seq送样前别把它们算混

生物学重复来自独立个体或独立实验单位，技术重复来自同一个样本的重复处理或测量。本文用常见…

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审稿与返修 · 2026-10-08

每组只有 3 个样本，被审稿人质疑样本量，怎么补救？

不能靠换检验、增加测序深度或拆分技术重复“制造”样本量。先查独立重复、离群点和效应稳定性，…

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审稿与返修 · 2026-10-07

审稿人说有批次效应：要重跑全部分析，还是先补一张表？

第一步不是换校正工具，而是检查批次与分组是否混杂。能否区分技术差异和生物差异，取决于实验…

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云生信学生物信息学 · 2026-09-25

RNA-seq 每组3个样本够不够？先别急着套固定答案

RNA-seq每组3个样本是否足够，取决于组内差异、目标变化、比较设计和研究用途。本文给出通俗判…

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