云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2026-09-22 空间转录组和单细胞怎么选？先看你缺哪类证据 想知道哪些细胞发生变化，还是变化发生在哪里？从研究问题出发，判断单细胞、空间转录组和联合… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2026-09-21 转录组与单细胞结果互相打架怎么办？先别急着选边站 转录组提示通路上调，单细胞却不显著；单细胞发现的亚群，批量数据却没有同步变化。本文从统计… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2026-09-19 转录组差异基因怎么选阈值？padj、FDR 与 log2FC 一次讲清 转录组差异基因用 P 值还是 padj？log2FC 选 1 还是 0.58？结合研究目的选择阈值，排查差异基因… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2026-09-17 GEO 数据挖掘怎么做？从数据筛选到结果验证 围绕研究问题筛选 GEO 数据，确认表达矩阵类型，设计分析主线与验证方案，避免结果零散、证据不… 阅读全文 ›
转录组分析 转录组分析 · 2026-09-12 一个转录组项目从初步结果到后续验证：我们具体解决了什么问题？（流程示例） 以假设的对照、模型和处理三组设计，演示转录组结果如何经过质量复核、功能解释和候选排序，形… 阅读全文 ›
单细胞分析 单细胞分析 · 2026-09-11 基质刚度相关基因集整理：1,400+候选基因，适用于转录组与单细胞分析 整理了一份包含1,400多个候选基因的基质刚度相关基因集，可用于Bulk RNA-seq、单细胞转录组、富… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-11-19 还不会分析RNA-seq数据？别慌，小花带你完成数据整合和差异分析 大家好啊，相信大家已经学会如何从头处理芯片原始数据了，在公共数据库中我们还经常会遇到转录… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-10-28 空间转录组学数据处理只依赖R语言？让我们从scanpy开始，拥抱python吧！ 前言 空间转录组学分析，是近几年的一个热点。相信小伙伴们对于seurat再熟悉不过了！但是seurat… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-10-28 一键启动RNA-Seq分析！EDASeq包，让基因数据自己说话！ 面对复杂的RNA-Seq数据，你是不是也曾感到无从下手呢？别担心，今天，小师妹要给你们展示一个超… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 云生信学生物信息学 · 2024-10-17 简单！一行代码完成RNA-seq下游分析！ Hello! 今天我很高兴地向大家介绍一个令人振奋的R包——RNAseqStat2。这款工具简直是生物信息学分… 阅读全文 ›