转录组分析

云生信学生物信息学

云生信学生物信息学 · 2024-02-02

CCPlotR: 可视化细胞间相互作用（scRNA-seq）

今天小果要分享的新鲜好包是2023年9月20日发表于Bioinformatics Advances上用于可视化 [&hellip…

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云生信学生物信息学 · 2024-01-31

超简单！使用spaceranger做空间转录组分析

今天小果带大家使用spaceranger进行空间转录组的分析。 空间转录组简介 传统的单细胞测序，是将…

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云生信学生物信息学 · 2024-01-29

从小白到空转达人：小果教你用Scanpy包玩转前沿热点空间转录组分析！

大家好呀，我们又见面啦，今天和大家聊聊单细胞和空转分析中一个很基础的包——Scanpy，Scanpy 是…

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云生信学生物信息学 · 2024-01-22

探索基因共表达网络：WGCNA揭示基因调控网络的奥秘

引言： 随着高通量测序技术的快速发展，我们能够获取大量基因表达数据，这为我们深入理解基因调…

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云生信学生物信息学 · 2024-01-18

差异分析魔法师：DESeq2与基因的魔幻冒险！

hello，今天小果教大家如何使用DESeq2包对counts表达矩阵进行差异基因分析，并对分析结果绘制火…

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云生信学生物信息学 · 2024-01-17

差异表达样本少无重复？快使用edgeR，小果三分钟教你上手

实验数据获得并不容易，而且成本高昂，有时只是想大致看一下几种条件的差异表达，在正式的实验…

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云生信学生物信息学 · 2024-01-11

基因探秘：用edgeR包揭示基因差异之谜 ！

hello，你知道如何使用edgR包来对RNA-seq数据进行基因表达差异分析嘛？今天小果就来叫你如何操…

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云生信学生物信息学 · 2024-01-09

高分生信SCI-WGCNA分析复现

今天小果给小伙伴带来的分享是啥呢？今天小果将复现一篇8+生信文章中的WGCNA分析，通过该推文将…

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云生信学生物信息学 · 2024-01-02

震惊！泛癌分析拿下37.3分！山东大学冯强团队：空间转录组联合单细胞，把CAF细胞玩出了花！

各位常年做生信的小伙伴们可能对泛癌分析已经无比熟练了，小云这两天在逛pubmed的时候，突然看…

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云生信学生物信息学 · 2023-12-26

震惊！泛癌分析拿下37.3分！山东大学冯强团队：空间转录组联合单细胞，把CAF细胞玩出了花！

各位常年做生信的小伙伴们可能对泛癌分析已经无比熟练了，小云这两天在逛pubmed的时候，突然看…

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