结果排查 · 09

多种铁死亡评分方向不一致，应该相信哪一个？

回答会区分适用条件、检查步骤和不能直接得出的结论。

先看结论：先不要选择“最符合预期”的结果。方向不一致通常来自基因集定义、上调与下调基因混合、输入层、对照校正、细胞组成或批次差异。应先定位差异来源，再决定主要结果和敏感性分析。

适用情况

同一批 bulk 或单细胞数据使用两种以上签名评分方法后，组间方向、显著性或细胞排序不一致。

建议按这个顺序检查

  1. 列出每种方法实际使用的基因、命中率、方向定义和输入矩阵，不只比较最后一列分数。
  2. 检查基因集中是否同时包含 driver、suppressor、marker，确认是否需要分开评分而不是简单合并。
  3. 在同一预处理输入上重跑，避免把不同 assay、不同归一化方式或不同样本子集的结果直接比较。
  4. 观察分歧是否由少数高表达基因、某一细胞类型比例或批次驱动。
  5. 预先指定主要方法；其他方法报告为敏感性分析，并解释一致和不一致的部分。

不能从当前结果直接得出什么

评分一致并不自动证明生物学结论正确；评分不一致也不意味着数据无效。没有基因集、代码、输入层和样本设计时，不能只看图判断哪一个更可靠。

依据与版本

最后核验：2026-10-10｜资料核验：公开来源核对