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云生信学生物信息学 · 2024-02-20

不做实验就可以发文章，为小伙伴们安利孟德尔随机化分析(MR)

今天小果为大家分享一下两样本孟德尔随机化分析流程，整个分析过程比较简单，该分析最重要的是…

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云生信学生物信息学 · 2024-02-20

利用棒棒糖图展示单细胞marker基因表达量

今天小果想用棒棒糖图来展示单细胞marker基因在不同细胞群里的表达量情况，展示出的效果非常不…

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云生信学生物信息学 · 2024-02-20

利用ggplot2绘制曼哈顿图

今天小果想通过ggplot2来绘制曼哈顿图，利用曼哈顿图展示微生物物种丰度差异，代码如下： 安装…

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云生信学生物信息学 · 2024-02-20

利用GO富集分析结果进行火柴杆图绘制

今天小果看到一个有趣的GO富集分析结果的展示形式，通过火柴杆图来展示GO富集结果，做了一下尝…

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云生信学生物信息学 · 2024-02-20

利用R语言进行Ensembl ID转换为Gene name

今天在做ssGESA分析的时候发现，TCGA下载的基因ID为Ensembl ID,下载的基因集为Gene na [&hellip…

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云生信学生物信息学 · 2024-02-20

利用tidyverse进行数据格式转换

今天小果想通过实例进行tidyverse数据格式转换的尝试，代码如下： 安装需要的R包 install.pac […

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云生信学生物信息学 · 2024-02-20

小果带你用homer进行motif富集分析

1 Homer是干嘛的？ HOMER是一套基于 C++ 和 Perl 语言的用于 motif 查找和二代数据分 […]

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云生信学生物信息学 · 2024-02-20

对多个分组进行生存分析

今天小果想对对3组及以上的亚组进行生存分析，并打印配对比较的统计表格，代码如下： install.p…

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云生信学生物信息学 · 2024-02-19

利用ggplot2绘制多角图绘制

今天利用ggplot2来进行多角图的绘制，代码如下： 安装需要的R包 install.packages(“gg [&hellip…

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云生信学生物信息学 · 2024-02-19

利用ggcor包绘制相关性图

今天小果利用ggcor包绘制好看的相关性图，代码如下： 安装需要的R包 install.packages(“g [&hel…

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云生信学生物信息学 · 2024-02-19

绘制基因位置环形图

今天小果绘制一下基因位置的环形图，绘图代码如下： 安装所需要的包 BiocManager::install(“ [&…

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云生信学生物信息学 · 2024-02-19

这个调控因子到底调不调控我的基因啊！——小果带你来学习FIMO数据库

近期有一位小伙伴私信小果，小伙伴是研究肌肉生长发育方向的，目前正在做一个基因的机制部分，…

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