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云生信学生物信息学 · 2024-01-31 超简单!使用spaceranger做空间转录组分析 今天小果带大家使用spaceranger进行空间转录组的分析。 空间转录组简介 传统的单细胞测序,是将… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 · 2024-01-31 基因组大数据可视化和分析中的佼佼者 — R语言包pathview R语言包Pathview是一个用于生物学数据可视化和分析的工具,主要用于在代谢通路和信号通路等方面… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 · 2024-01-31 sratools:一站式解决 SRA 数据下载、转换和分析问题 大家好,我是小果,今天我要给大家介绍一个超级好用的生信小工具,叫做sratools。sratools是什… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 · 2024-01-31 数据处理的命令太复杂了?来看看数据巫师datawizard 数据处理是我们作为生信研究人员最重要也是最麻烦的一步,R包千罗万象,要求的格式也是五花八门… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 · 2024-01-31 敲黑板了!!小果教你通过ssGSEA算法评估肿瘤免疫浸润程度!!! 小伙伴还在为免疫细胞浸润分析而困扰吗,是否不知道如何去做免疫浸润分析,有时候面对单样本的… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 · 2024-01-31 拟时序分析不会做?R包Monocle3来解决 今天小果来为大家介绍细胞拟时序分析以及如何使用monocle3做细胞拟时序分析。 那么什么是细胞拟… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 · 2024-01-31 绚丽降维之旅:Rtsne和umap带你探索基因数据的降维秘密! 你知道吗,有两个R包实现了t-SNE(t-distributed stochastic neighbor em […] 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 · 2024-01-31 三分钟学会用ggpairs绘制相关矩阵 ggpairs()简介 在学习ggpairs之前我们可以先来欣赏一下这个包绘制的图形如下, 每对数值变量… 阅读全文 ›
云生信学生物信息学 · 2024-01-31 用R语言包GSVA,将数据转化为样本与基因关联矩阵,帮助你更直观且高效的分析 在生物学研究中,高维基因表达数据的分析是一项重要且挑战性的任务。为了揭示基因表达在不同生… 阅读全文 ›