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云生信学生物信息学 · 2024-01-25

纯代码实操，小果带你计算基因与免疫细胞在TMB中的相关性

我们大家知道基因与多种免疫细胞类型之间有着相关性，那么了解指定基因与免疫细胞类型之间的相…

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云生信学生物信息学 · 2024-01-25

单细胞测序分析（五）R包Seurat三种算法对数据聚类降维

大家好，小果今天继续介绍R包Seurat单细胞测序分析。 上一期我们用Seurat对数据进行了进一步的…

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云生信学生物信息学 · 2024-01-25

学会CMplot，绘制出比qqman更优秀的GWAS可视化结果

在最近的这段时间里相信做科研的各位小伙伴都被GWAS和孟德尔随机化刷过屏，小果也有在做教学的…

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云生信学生物信息学 · 2024-01-25

testing-based procedures减少变量简化模型预测结果的好帮手

在统计假设检验中，testing-based procedures是一类常用的方法，用于在生物信息数据学中进行 [&…

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云生信学生物信息学 · 2024-01-25

保姆级教程！！小果教你学习曼哈顿图！Manhattan图！！

有的小伙伴可能听说过曼哈顿图，但是并不了解，也不知道是来做什么的，其实，曼哈顿因为其形似…

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云生信学生物信息学 · 2024-01-25

敲黑板！！小果教你学习R包-ggalluvial，绘制炫酷的桑基图（Sankey）！！

小伙伴平时面对多个数据关系不知道如何绘制图，一般来说使用常见的表格已经满足不了小伙伴，并…

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云生信学生物信息学 · 2024-01-25

只需三分钟！小果教你在绘制的热图添加注释信息！！

有不少小伙伴在绘制热图时候，绘制的图信息很少，只有名称和相关性值，有时看起来枯燥乏味。小…

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云生信学生物信息学 · 2024-01-25

单细胞测序分析（四）R包Seurat下游分析

上一期小果用loupe brosew进一步探索单细胞测序处理结果，但是它的功能有限，还无法实现复杂的…

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云生信学生物信息学 · 2024-01-24

SCP探索单细胞宇宙的魔法工具，加速生物信息学研究

在之前，小果为大家介绍了popsicleR这个令人惊叹的R包，它提供了从单细胞分析质控到细胞注释的…

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云生信学生物信息学 · 2024-01-24

三分钟绘制双曲线新型火山图-双曲线火山图

最近在很多的文章中出现了下图类似的新型火山图，其实原理就是，分别以原来的的阈值线为基准，…

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云生信学生物信息学 · 2024-01-24

R语言包GenomicRanges带你五分钟快速处理基因组区间数据

GenomicRanges是R语言中一个强大而灵活的生物信息学包，主要用于处理基因组区间数据。在生物信…

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云生信学生物信息学 · 2024-01-24

R语言包generics教你快速通过函数简化并处理生物学数据

R语言包generics在生物学领域中发挥着重要的作用，提供了一种通用的方法来定义函数，使得用户可…

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