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云生信学生物信息学 · 2024-01-17

差异表达样本少无重复？快使用edgeR，小果三分钟教你上手

实验数据获得并不容易，而且成本高昂，有时只是想大致看一下几种条件的差异表达，在正式的实验…

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云生信学生物信息学 · 2024-01-17

非模式生物基因注释信息不会找？不怕，小果教你用AnnotationHub包轻松拿捏

非模式生物的注释信息检索 自RNA测序（RNA-seq）的技术被发明以来，它在分子生物学的领域内得到…

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云生信学生物信息学 · 2024-01-17

干货批量处理泛癌相关生存KM分析绘图

生存分析中的Kaplan-Meier曲线（也称为KM曲线）是一种常用的统计方法，用于估计不同组别之间的…

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云生信学生物信息学 · 2024-01-17

小果带你批量处理泛癌生存分析

生存分析是一种统计方法，用于分析个体在给定时间段内发生某个事件（如死亡）的概率或时间。生…

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云生信学生物信息学 · 2024-01-17

小果三分钟教会你如何对Trinity转录本进行下游分析（下）

在上一期的教学中小果讲到了如何下载和使用Trinity组装转录本，并且评估转录本的质量，在本期中…

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云生信学生物信息学 · 2024-01-17

小果三分钟教会你如何使用Trinity做转录本组装（上）

Trinity, 是由Broad Institute开发的进行de novo转录本组装的工具，它能将RNA-s […]

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云生信学生物信息学 · 2024-01-17

一分钟带你了解Cook’s Distance，教你如何分析评估观测值对回归分析结果的影响

Cooks距离（Cooks distance）是一种用于识别在统计回归分析中具有高影响力的观测值的统计量。它…

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云生信学生物信息学 · 2024-01-17

手把手教你基因进化树的构建（二）

在这一篇中，小果将带大家学习如何去使用Mega软件做多序列的比对和构建基因进化树。 首先，先和…

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云生信学生物信息学 · 2024-01-17

手把手教你基因进化树的构建（一）

对于基因进化树的构建，大家应该都很苦恼吧。最近小果刚好需要构建进化树，在经过学习之后，也…

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云生信学生物信息学 · 2024-01-17

一分钟带你了解R语言包leaps，带你快速预测变量子集

R包”leaps”是一个用于子集选择（subset selection）的R语言软件包 […]

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云生信学生物信息学 · 2024-01-17

用ggplot2一分钟绘制好看的气泡图

气泡图是一种多变量图表，是散点图的变体，也可以认为是散点图和百分比区域图的组合。气泡图最…

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云生信学生物信息学 · 2024-01-17

基因之旅：clusterProfiler揭示富集分析世界的奥秘！

你知道如何使用clusterProfiler对DOSE包中的数据进行功能富集分析嘛？今天小果就来教你轻松完成…

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