蛋白组学算力需求

蛋白质组学分析主要处理 LC-MS/MS 质谱数据,使用 MaxQuant / Proteome Discoverer / OpenMS 等工具。

样本数CPU内存存储典型耗时
10 以内16 核32 GB500 GB2-4 小时
10-5032 核64 GB1-2 TB4-8 小时
50-20032 核64 GB2-3 TB8-24 小时

特点:蛋白组学工具的并行效率中等(多数只用到 8-16 线程),CPU 核数超过 32 后提升不明显。内存需求相对其他组学较低。瓶颈在于数据库检索速度和存储。